В соответствии с Законом Республики Казахстан «О науке», Государственной программой развития образования в Республике Казахстан, где предусмотрена тесная взаимосвязь обучения и научных исследований на всех ступенях образовательного процесса, Академия Кайнар обеспечивает интеграцию науки с образовательным процессом, модернизируя содержание образовательного процесса. Согласно статье 23 Закона Республики Казахстан «О науке» Учреждение Академия Кайнар аккредитован в качестве субъекта научной и научно-технической деятельности. Имеется свидетельство об аккредитации Серия МК № 004659 от 26 ноября 2015 года.
Приоритеты Академии Кайнар в области НИР отражены в миссии вуза: «Качественное образование сегодня, обеспеченное будущее завтра» и заключается в предоставлении образовательных услуг в области экономики и бизнеса, образования, культуры и активно содействовать инновационному развитию Республики Казахстан
Научные исследования формируются с учетом научной компетенции, опыта НИР и материально-технической базы кафедр академии. Тематика исследования охватывает как международные, так и республиканские проблемы в области экологии, энергетики и социально-гуманитарных наук и др. ППС академии, сотрудники, студенты, магистранты информированы о политике вуза в сфере НИР
Научная деятельность преподавателей и студентов является составляющей частью стратегии Академии, осуществляется в соответствии со Стратегическим планом Академии и полностью соответствует миссии Академии.
В качестве задач в научной сфере обозначено:
